肾结石碎石后仍疼痛剧烈，原因是多方面的，碎石过程虽将较大结石击碎，但后续身体反应及结石排出状况等因素，都可能引发疼痛，如碎石排出刺激、输尿管痉挛等。
1、碎石排出刺激：碎石后，小结石颗粒在通过输尿管排出体外的过程中，会刺激输尿管黏膜。输尿管黏膜有丰富的神经末梢，受到结石摩擦时，就会产生疼痛感，疼痛通常是阵发性的，随着结石的移动而发作。
2、输尿管痉挛：碎石后，输尿管为了将结石排出，会发生蠕动，当蠕动过于强烈或不协调时，就会引发输尿管痉挛。输尿管痉挛会导致管腔狭窄，阻碍结石排出，进一步加重疼痛。
3、局部黏膜损伤：在碎石过程中，冲击波可能会对肾脏和输尿管的局部黏膜造成一定损伤。黏膜损伤后，会出现充血、水肿等炎症反应，刺激周围神经，从而产生疼痛。
4、输尿管炎：结石在排出过程中，可能会损伤输尿管黏膜，使细菌容易侵入，引发输尿管炎。炎症会导致输尿管黏膜充血、水肿，管腔狭窄，不仅影响结石排出，还会加重疼痛，此时的疼痛除了结石排出的刺激，还伴有炎症带来的不适。
5、肾积水：如果碎石后，结石碎片未能顺利排出，堵塞了输尿管，就会导致尿液排出受阻，引起肾积水。肾积水会使肾脏内压力升高，肾包膜受到牵拉，从而产生剧烈疼痛。
肾结石碎石后疼痛剧烈的原因复杂多样，若疼痛持续不缓解，应及时就医查明原因，此类患者可以前往医院泌尿外科就诊，明确自身情况。
肾结石碎石后疼痛加剧应做哪些检查
- 泌尿系统超声检查：通过超声可以清晰观察到肾脏、输尿管和膀胱的形态、大小，判断是否存在结石残留、结石位置以及有无肾积水、输尿管扩张等情况，能快速发现结石碎片堵塞尿路导致疼痛加剧的原因，为后续治疗提供重要依据。
- CT检查：CT检查的分辨率较高，不仅能发现泌尿系统超声和X线平片难以检测到的小结石、阴性结石，还能清晰显示泌尿系统的细微结构，明确是否存在输尿管狭窄、黏膜损伤程度以及周围组织的病变情况。
- 尿常规检查：尿常规可以检测尿液中的红细胞、白细胞、细菌等指标，如果碎石后出现疼痛加剧，尿常规中白细胞增多可能提示存在泌尿系统感染，红细胞增多则可能与结石损伤尿路黏膜有关，有助于医生判断疼痛是否由感染或黏膜损伤进一步加重引起。