尿拭子后尿道一直刺疼的原因常见于尿道损伤、细菌感染、膀胱炎、尿道结石、输尿管结石等。具体情况建议前往正规医院就诊检查，明确病因后遵医嘱进行药物治疗、手术治疗等。
1、尿道损伤：尿道拭子检查时，如果医生操作不当或用力过大，可能会损伤尿道黏膜，导致尿道疼痛，通常不伴有其他特殊不适。建议遵医嘱多喝水，多排尿，以冲洗尿道，促进尿道黏膜的恢复；
2、细菌感染：尿道拭子检查后，尿道受到细菌感染可能引发炎症，导致尿道疼痛，并可能伴有尿频、尿急等症状。需要遵医嘱使用抗生素来治疗感染，如阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片等；
3、膀胱炎：膀胱炎是膀胱内发生的炎症，可由细菌感染引起。尿道拭子检查后，如果细菌上行至膀胱，可能引发膀胱炎，导致尿道疼痛、尿频症状。建议及时就医，遵医嘱应用青霉素V钾片、头孢克肟颗粒等药物治疗；
4、尿道结石：尿道结石是在尿道内形成的结石，可能导致尿道阻塞，排尿时疼痛。尿道拭子检查可能刺激到结石，导致疼痛，甚至是血尿等。如果结石较小，可以遵医嘱尝试通过多喝水、多排尿等方式自然排出。如果结石较大，可能需要遵医嘱通过手术或体外碎石等方式来移除结石；
5、输尿管结石：在进行尿拭子检查或日常排尿时，输尿管结石的位置可能会发生变化。位置移动可能会划伤尿道上皮，造成尿道损伤，从而引发疼痛和血尿表现。建议及时就医，遵医嘱应用输尿管镜取石术、经皮肾镜取石术等手术方式进行治疗。
患者要严格遵医嘱服药，并注意药物的不良反应，常见的包括恶心、呕吐或腹泻等，发生不良反应时要及时告知医生。