3周岁孩子发烧39.3℃但睡眠良好并不都需要叫醒，若孩子情况良好，且刚刚入睡，多不需要叫醒。但若未服用退烧药、体温持续性升高、或有明显脱水的情况，都需要叫醒。另外出现病情加重或行为异常时，同样需要叫醒，建议尽早前往儿科就诊，以促进体温的恢复。
一、不需要叫醒的情况
若孩子在入睡前有服用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚混悬滴剂等退热药物，并且孩子刚入睡，且入睡后呼吸平稳、皮肤状况良好，说明孩子睡眠正常，一般无须叫醒。
二、需要叫醒的情况
1、未服用退烧药：39.3℃对于3周岁的孩子属于高热，若没有服用退烧药，可能导致孩子出现高热惊厥，还有可能影响神经发育。故而此时应先将孩子叫醒，并予以退烧药物，以预防不可逆的情况。
2、体温持续性升高：如果孩子体温在睡眠过程中出现体温持续升高，超过39.5℃，需要将孩子唤醒，并对颈部、大腿根、额头进行温水擦拭。同时，还应遵医嘱使用对乙酰氨基酚颗粒、小儿柴桂退热颗粒等退热药。
3、明显脱水：因高热可能导致孩子水分流失增多，若孩子虽睡眠良好，但有唇部干燥、口唇起皮、皮肤弹性变差等情况，可能提示脱水，建议将孩子唤醒后，予以淡盐水，以补充孩子缺失的水分和电解质。
4、病情加重：在孩子睡眠过程中，若出现了呼吸急促、呼吸短快、两便失禁的症状，多说明病情加重，建议及时唤醒，并前往医院，以便及时治疗。
5、行为异常：若孩子出现了胡言乱语、肢体抽动的情况，可能提示有神经受损，建议唤醒后及时前往医院，以免耽误治疗。
需注意，若孩子突然出现惊厥，或有肢体抽搐的情况，建议立即进行保护，并拨打120，以促进孩子的恢复。