基底动脉闭塞的治疗效果因闭塞发生的急缓、梗死灶大小、基础疾病等因素而异，及时诊断和恰当治疗对预后至关重要，通过早期诊断、综合治疗和积极的康复，仍可为患者争取更好的预后。
1、急性闭塞且治疗及时：如果基底动脉闭塞是急性发生，并且在发病后的短时间内得到及时有效的治疗，如进行溶栓治疗或机械取栓，有可能使血管再通，恢复脑部供血。患者可能恢复良好，甚至不留明显后遗症，达到临床治愈的效果。
2、慢性进展性闭塞：对于慢性进展性的基底动脉闭塞，由于血管逐渐狭窄直至完全闭塞，侧支循环有一定的时间建立，患者的症状可能相对较轻，如果能通过改善脑循环、营养神经等治疗方法，控制病情进展，患者的生活质量可以得到一定程度的维持。
3、闭塞伴少量梗死灶：基底动脉闭塞如果导致的梗死灶较小且位于非关键部位，经过积极的治疗，包括康复训练、改善生活方式等，患者的神经功能可能会有较好的恢复，部分功能障碍能够得到改善。
4、闭塞伴大面积梗死：当基底动脉闭塞造成大面积脑梗死时，患者往往会出现严重的神经功能缺损，如昏迷、偏瘫、失语等。即使经过治疗，预后也较差，可能会遗留严重的残疾，甚至危及生命。
5、基础疾病多且严重：若患者本身患有多种严重的基础疾病，如高血压、糖尿病控制不佳，或者有心脏疾病等，这会极大地影响基底动脉闭塞的治疗效果和预后。即使采取积极的治疗措施，也很难完全恢复，且复发的风险较高。
日常保持低盐低脂饮食，适量运动，戒烟限酒，有助于维护脑血管健康，严格遵医嘱服药或接受治疗方案，切勿自行停药或更改治疗方案，定期进行影像学检查，如MRI、CTA等，以监测基底动脉的形态变化。