巧克力囊肿主要是通过综合方法检查出来，较为常用的为体格检查，还有超声检查、CT/MRI检查等，此时一般需要结合具体情况进行选择。
1、体格检查：体格检查是诊断巧克力囊肿的重要环节，通过触诊检查盆腔区域，特别关注是否存在异常肿块或压痛，当巧克力囊肿较大时，妇科检查可以摸到与子宫粘连的肿块或触痛性结节。
2、超声检查：超声检查是诊断巧克力囊肿的主要方法，包括经阴道超声和经腹部超声，超声波探头可以清晰地观察到卵巢囊肿的大小、数量、位置等情况，典型的巧克力囊肿超声影像为无回声区内有密集光点，内部充满点状强回声，这是巧克力囊肿的典型特征。
3、CT/MRI检查：CT和MRI是更加精确的检查方法，适用于复杂的巧克力囊肿，这些检查可以更清晰地观察卵巢囊肿的情况，帮助更准确地判断囊肿的性质和范围。
4、血清CA125测定：血清CA125测定是辅助检查方法，虽然巧克力囊肿患者的血清CA125水平可能会轻度升高，由于其特异性及敏感性均有限，血清CA125不用于诊断巧克力囊肿，但可以用于监测病情变化。
5、病理检查：病理检查是诊断巧克力囊肿的金标准，通过手术、穿刺或活检取得样本，进行病理检查，病理检查可以明确囊肿的性质，为治疗提供可靠依据。
6、腹腔镜检查：腹腔镜检查是目前诊断巧克力囊肿的最佳方法，在麻醉下通过腹壁小孔插入腹腔镜检查器械，观察和评估盆腔状况，并可能取材进行病理检查，这种方法具有直观、准确的特点，对于复杂或疑似恶变的囊肿尤为重要。
针对巧克力囊肿患者，建议避免寒冷刺激，保持身体温暖，减少剧烈运动，以免加重囊肿破裂的风险，保持营养均衡，避免刺激性食物，定期进行妇科检查，及时发现病情变化。
检查出来巧克力囊肿怎么治疗
- 口服避孕药或抗雌激素治疗通过调节激素水平，抑制卵巢功能，减少囊肿的生长，而这些药物通常需要长期服用，停药后可能会复发，且伴有月经周期紊乱或停经等副作用，非甾体抗炎药具有镇痛抗炎效果，可缓解患者疼痛，激素类药物抑制卵巢功能，阻止病情发展。
- 囊肿剥除术通过手术将囊肿从卵巢上剥离下来，尽量保留正常的卵巢组织，以减少对生育功能的影响。但囊肿可能复发，患侧卵巢切除术适用于年龄较大、没有生育要求或囊肿过大、难以剥除的患者，切除一侧或双侧卵巢以降低复发概率。