早上醒来肚子隐隐不舒服可能由饮食因素、腹部着凉、心理因素、疾病影响等多种原因引起，需明确原因进行针对性处理。
1、饮食因素：前一晚进食过多、过快，或食用不易消化的食物等，可能导致消化不良，引起晨起肚子不舒服。应调整饮食结构，避免暴饮暴食，减少油腻、辛辣食物的摄入，多吃蔬菜、水果等富含膳食纤维的食物，促进肠胃蠕动。
2、腹部着凉：夜间睡眠时腹部保暖不当，可能使肠胃受到寒冷刺激，出现不适，可进行腹部热敷，喝温热饮品。用热水袋热敷腹部，能促进血液循环，缓解肠道痉挛，减轻不适症状，注意夜间睡眠时盖好被子，避免腹部着凉。
3、心理因素：压力、焦虑等情绪问题可能影响肠胃功能，导致晨起肚子不舒服。要学会调整心态，缓解压力，通过冥想、深呼吸、运动等方式放松身心，减轻心理负担，保持良好的心态，有助于肠胃功能的正常运转。
4、疾病影响：如胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡等，可能引起晨起肚子隐痛，需及时就医，进行检查和治疗，通过胃镜等检查手段明确病因，根据病情使用相应的药物治疗。某些全身性疾病，如内分泌失调、肝胆疾病等，也可能导致晨起肚子不舒服。应进行全面的身体检查，排查潜在疾病。
日常生活中应注意保持良好的饮食习惯，定时定量进餐，避免过度进食和夜宵，注意腹部保暖，尤其是在季节交替和夜间睡眠时。保持心情舒畅，避免过度紧张和焦虑。