小便的时候尿道刺痛是否会自己好，取决于导致刺痛的原因，如轻微的刺激、感染、结石、损伤等。
- 比如短期内饮水过少、憋尿时间过长、性生活过于频繁等，属于较轻微的刺激，通过调整生活方式，如增加饮水量、避免憋尿、适度控制性生活频率等，可能会自行好转。
- 如果是尿道炎、膀胱炎等泌尿系统感染引起，会导致尿道黏膜充血、水肿，引起刺痛。如果不及时治疗，感染可能会加重，出现尿频、尿急、血尿等更为严重的症状。
- 如果是尿路结石，比如膀胱结石、尿道结石等，在排尿过程中可能刺激尿道壁，产生刺痛感。由于结石一般不会自行排出，因此通常需要采用相应的治疗措施进行缓解，无法自行好转。
- 尿道损伤如外伤或医源性损伤，如果不进行处理，可能会导致感染、狭窄等并发症，局部刺痛感也难以缓解。
所以，如果出现小便的时候尿道刺痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、泌尿系统超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。