睡醒起来头疼的原因多种多样可能与生活作息不规律、睡眠姿势不当、环境质量不佳、疾病因素等多方面有关，当出现这种症状时，观察症状是否有所改善，如症状持续或加重，应及时就医，进行相关检查以明确病因并进行治疗。
1、生活作息不规律：
- 长时间的熬夜或睡眠过多都可能导致睡醒后头疼，熬夜会打乱正常的睡眠周期，影响睡眠质量，而过度的睡眠则可能使大脑在睡眠中处于过度抑制状态，醒来时感到不适。
2、睡眠姿势不当：
- 颈部受压：不合适的枕头或睡眠姿势可能导致颈部受压，影响脑部血液循环，醒来时感到头疼。
- 血管受压：某些睡眠姿势可能使血管受到压迫，导致脑部供血不足，引发头疼。
3、环境质量不佳：
- 室内空气不流通：长时间处于密闭、空气不流通的环境中睡眠，可能导致二氧化碳浓度升高，引起头疼。
- 温度与湿度：室内温度过高或过低、湿度过大也可能影响睡眠质量，导致醒来时头疼。
4、疾病因素：
- 呼吸系统疾病：如鼻窦炎、鼻炎等，夜间睡眠时可能影响呼吸，导致脑部缺氧，醒来时头疼。
- 神经系统疾病：如偏头痛、三叉神经痛等神经系统疾病，可能会对神经造成刺激，也可能导致睡醒后头疼。
建议患者在日常生活中应调整生活作息和睡眠习惯，避免自行滥用止痛药物，以免掩盖病情或产生不良反应。