疱疹性咽峡炎并不属于手足口病，虽然两者存在一些相似之处，但本质上是由不同病因引起、具有不同临床表现和特点的两种疾病。
- 疱疹性咽峡炎主要由肠道病毒中的柯萨奇病毒A组引起，少数由其他肠道病毒导致。其主要症状为发热、咽痛，口腔咽峡部出现疱疹和溃疡。而手足口病多由肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型等引起，除口腔疱疹、溃疡外，手、足、臀部等部位还会出现斑丘疹、疱疹。
- 从发病部位来看，疱疹性咽峡炎的疱疹和溃疡主要集中在口腔后部的咽峡部，如扁桃体、软腭、悬雍垂等部位，而手足口病的皮疹分布范围更广，除口腔外，手部、足部、臀部等部位也会出现典型皮疹。这是区分两者的重要依据之一。
- 在病情严重程度方面，疱疹性咽峡炎多数为轻症，病程具有自限性，一般在1周左右症状逐渐缓解，发热消退，疱疹愈合。但手足口病部分患者可能会发展为重症，尤其是由肠道病毒71型感染引起的，可累及神经系统、呼吸系统、循环系统等，出现脑膜炎、肺水肿、循环衰竭等严重并发症，危及生命。
另外，两者在治疗原则上也存在差异。疱疹性咽峡炎主要以对症治疗为主，如退热、缓解咽痛等，多数患者可自行恢复。手足口病轻症患者同样采取对症治疗，但对于重症患者，需要密切监测病情变化，及时给予抗病毒、降低颅内压、维持呼吸循环稳定等综合治疗措施。
疱疹性咽峡炎、手足口病的预防措施
1、保持良好卫生习惯：勤洗手，特别是在饭前便后、接触公共物品后、外出回家后，应使用流动水和肥皂或洗手液按照七步洗手法洗手。在接触患儿的分泌物、尿布或其他污染物后，也应立即洗手。
2、加强环境清洁与消毒：定期清洁和消毒常接触的表面，如门把手、楼梯扶手、桌面、玩具等。保持室内空气流通，每天开窗通风2-3次，每次不少于30分钟。
3、避免接触患者：在疾病流行期间，尽量避免与患者密切接触，如拥抱、亲吻、共用餐具或玩具等。减少前往人群密集、空气流通差的公共场所，如商场、游乐场等。