中枢神经系统感染通常由多种因素引发，可能与病毒感染、细菌感染、真菌感染、寄生虫感染、自身免疫功能紊乱等因素有关。
1、病毒感染：多种病毒可侵犯中枢神经系统，如单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒等。单纯疱疹病毒可通过呼吸道或皮肤黏膜进入人体，经血行播散到达脑部，引起病毒性脑炎。病毒在神经细胞内复制，破坏神经组织，导致炎症反应。
2、细菌感染：如脑膜炎球菌、结核杆菌等可引起中枢神经系统感染，当人体感染结核杆菌后，如果机体免疫力低下，结核杆菌可进入血液循环，并随血流到达脑部，导致中枢神经系统感染。
3、真菌感染：如新型隐球菌等可感染中枢神经系统，新型隐球菌主要通过呼吸道吸入，在肺部形成病灶后，可经血行播散至脑部，引起隐球菌性脑膜炎。真菌在脑内生长繁殖，形成肉芽肿，压迫周围神经组织。
4、寄生虫感染：某些寄生虫如脑囊虫、弓形虫等可寄生在中枢神经系统，引起感染。寄生虫在脑内活动，破坏神经组织，引发炎症反应。
5、自身免疫功能紊乱：机体可能产生针对自身神经组织的抗体，导致中枢神经系统炎症，如自身免疫性脑炎是由于免疫系统错误地攻击神经细胞表面的抗原，引起脑部炎症。
日常生活中要注意增强自身免疫力，保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、适度运动等。避免接触感染源，注意个人卫生，勤洗手，在流感等传染病流行季节，尽量避免去人员密集的场所。对于免疫力低下的人群，如老年人、儿童、患有慢性疾病者，要特别注意预防感染。