医学上评估后遗症风险时，更强调个体化匹配原则，而非绝对的术式优劣。开颅手术的后遗症可能集中在创伤相关领域，微创则需警惕操作空间限制带来的神经损伤风险。临床选择的核心是结合病变特点、患者情况，由神经外科医生制定最优方案，通过精准操作将后遗症风险降至最低，而非单纯比较两种术式的风险高低。
从医学定义来看，开颅手术是通过切除部分颅骨形成手术入路，直接暴露颅内病变区域，适用于体积较大、位置深在或与周围组织粘连紧密的肿瘤、大面积脑出血等情况。这类手术因需打开颅骨，对头皮、颅骨及周围软组织的创伤相对明显，术后局部疼痛、颅骨缺损相关不适等表层后遗症发生率较高。而微创颅内手术多借助神经内镜、立体定向等技术，通过小孔或自然腔道操作，创伤范围局限，表层组织损伤较轻。
后遗症的核心影响因素在于手术对脑组织的扰动程度，而非单一的创伤大小，开颅手术虽创伤范围广，但在处理复杂病变时，术者视野清晰，可精准分离病变与正常脑组织，若操作规范，对核心功能区的保护反而更充分，部分患者术后仅遗留轻微头痛、头晕，无明显神经功能障碍。反之，微创并非零风险，若病变位于语言、运动等关键功能区，狭小操作空间可能增加脑组织牵拉或血管损伤风险，引发失语、肢体无力等后遗症。
病变本身的性质与位置对后遗症的影响远超手术方式的选择，例如，位于脑干的微小肿瘤，即便采用微创技术，也可能因手术操作刺激生命中枢，导致吞咽困难、呼吸功能异常等严重后遗症；而位于大脑非功能区的较大脑膜瘤，开颅手术完整切除后，患者可能仅需面对短期颅骨修复相关的不适，神经功能不受影响。此外，患者术前身体状况也至关重要，高龄、合并基础疾病者，无论何种术式，术后感染、认知功能下降等后遗症风险均会升高。