梅毒的潜伏期长短不一，从一期梅毒的2-4周，到二期梅毒的2个月，再到潜伏梅毒和三期梅毒的数年甚至数十年，随着病情的发展，梅毒的症状逐渐加重，治疗难度也随之增加。
1、一期梅毒潜伏期：此阶段通常持续2-4周，患者感染梅毒后，首先进入一期梅毒，此时主要表现为硬下疳和淋巴结肿大，但硬下疳往往不痛不痒，易被忽视，相较于后续阶段，一期梅毒的症状相对轻微，但若未及时治疗，病情将进一步发展。
2、二期梅毒潜伏期：一期梅毒未经治疗或治疗不彻底，梅毒螺旋体将进入血液，形成二期梅毒，此时潜伏期可长达2个月，二期梅毒以皮肤黏膜损害为主，如梅毒疹、扁平湿疣等，全身症状较轻，相较于一期，二期梅毒的症状更为明显，传播性也更强。
3、潜伏梅毒期：此阶段患者无明显症状，但梅毒螺旋体仍在体内潜伏，可持续数年甚至10年，潜伏梅毒期虽无显性症状，但患者仍具有传染性，且病情可能随时复发，对长期健康构成威胁。
4、三期梅毒潜伏期：若梅毒长期未得到治疗，将进入三期梅毒，此时潜伏期也可长达数年甚至20年，三期梅毒以心血管和神经系统损害为主，如主动脉炎、主动脉瘤、脊髓痨等，症状严重且难以逆转，此阶段治疗难度大，患者预后较差。
作为三期梅毒的严重表现，神经梅毒与心血管梅毒的潜伏期同样可长达数十年，这两种类型的梅毒均可导致严重的功能障碍甚至危及生命，相较于其他阶段，神经梅毒与心血管梅毒的病情最为严重，治疗难度极大。