屁眼长肉球且疼可能是血栓性外痔、炎性外痔、肛周脓肿、内痔嵌顿、肛管直肠肿瘤等所致，应根据不同病因采取坐浴、涂抹药膏、手术等相应治疗，应及时就医明确诊断，采取恰当的治疗措施。
1、血栓性外痔：外痔内的血管破裂，血液在皮下凝结形成血栓，导致肉球肿胀、疼痛。多因长时间久坐、蹲厕、用力排便等引起。应避免久坐久站，养成良好的排便习惯。可采用温水坐浴，促进血液循环，缓解疼痛。若症状严重，可能需要手术切除血栓。
2、炎性外痔：外痔发生炎症，出现红肿、疼痛。通常是由于肛门周围不洁、摩擦刺激等导致。保持肛门清洁，便后用温水清洗。注意休息，减少活动对肛门的摩擦。局部可涂抹消炎止痛的药膏，以减轻炎症反应。
3、肛周脓肿：肛管直肠周围软组织或其周围间隙发生急性化脓性感染，并形成脓肿。表现为肛门周围的肿块，疼痛剧烈。早期可通过热敷、应用抗生素等治疗。一旦脓肿形成，通常需要手术切开引流，排出脓液。
4、内痔嵌顿：内痔脱出肛门外不能回纳，受到括约肌的挤压，导致血液回流障碍，引起肿胀、疼痛。应及时将内痔回纳，若无法回纳，需尽快就医。卧床休息，减少活动，避免内痔进一步受压。
5、肛管直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，随着肿瘤的生长，可能会突出肛门，伴有疼痛。需要尽快就医，进行相关检查，如直肠指诊、肠镜等，以明确肿瘤的性质。根据病情，可能采取手术、放疗、化疗等治疗方法。
日常保持卫生，注意肛门周围清洁，避免感染，多吃富含纤维的食物，保持大便通畅，减少排便时对肛门的刺激，避免久坐久站，适当活动，促进肛门部位血液循环。