男性生殖器官主要包括内生殖器和外生殖器两个部分，内生殖器包括睾丸、输精管道、附属腺，外生殖器主要包括阴囊、阴茎等。
一、内生殖器
1、睾丸：位于阴囊内，左右各一，扁椭圆体，分上下端，内外、前后缘，表面的致密结缔组织叫白膜。在睾丸后缘，白膜增厚并突入睾丸实质内形成放射状的小隔，把睾丸实质分隔成许多锥体形的睾丸小叶，每个小叶内含2-3条曲细精管。曲细精管之间的结缔组织内有间质细胞，可分泌男性激素。
2、输精管道：包括附睾、输精管、射精管，附睾紧贴睾丸的上端和后缘，可分为头、体、尾三部，头部由输出小管组成，输出小管的末端连接一条附睾管。输精管长约40厘米，呈紧硬圆索状，行程较长，与精囊腺的排泄管合成射精管。射精管长约2厘米，穿通前列腺实质，开口于尿道前列腺部。
3、附属腺：包括精囊腺、前列腺、尿道球腺，精囊腺是椭圆形囊状器官，位于膀胱底之后，输精管壶腹的外侧，其排泄管与输精管末端合成射精管。前列腺可分泌含较多草酸盐和酸性磷酸酶的乳状碱性液体，以中和射精后精子遇到的酸性液体，从而保证精子的活动和受精能力。尿道球腺可分泌蛋清样碱性液体，排入尿道球部，参与精液组成。
二、外生殖器
1、阴囊：是由皮肤构成的囊，皮下组织内含有大量平滑肌纤维叫肉膜，肉膜在正中线上形成阴囊中隔将两侧睾丸和附睾隔开。阴囊内部温度低于体温，对精子发育和生存有重要意义。精细胞对温度比较敏感，因此体温升高时阴囊舒张，便于降低阴囊内的温度，当体温降低时阴囊收缩，以保存阴囊内的温度。
2、阴茎：可分为阴茎头、阴茎体和阴茎根，头体部间有环形冠状沟。阴茎由两个阴茎海绵体和一个尿道海绵体，外面包以筋膜和皮肤而构成，尿道海绵体有尿道贯穿其全长，前端膨大即阴茎头，后端膨大形成尿道球。海绵体根部附着肌肉，协助排尿、阴茎勃起及射精，阴茎皮肤薄而易于伸展，适于阴茎勃起。
此外，还包括尿道。人类的生殖是通过生殖器的生理活动实现，包括生殖细胞的形成、交配、受精、着床、胚胎发育、成熟、分娩等，并且生殖器对于人类的体格发育、心理活动、及生理功能有着重要意义。