左氧氟沙星和盐酸左氧氟沙星的主要成分相同，抗菌谱基本一致，但在化学结构、药物吸收和代谢、临床应用、不良反应等方面存在一些差异。
1、化学结构不同：左氧氟沙星是一种喹诺酮类抗菌药物。盐酸左氧氟沙星是左氧氟沙星与盐酸成盐后的产物。
2、药物吸收和代谢不同：一般来说，由于盐酸左氧氟沙星的溶解性更好，在口服给药时，可能会比左氧氟沙星有稍快的吸收速度，能够更快地进入血液循环发挥药效。不过，这也会受到剂型、患者个体差异等多种因素的影响。
3、临床应用不同：虽然左氧氟沙星和盐酸左氧氟沙星都属于喹诺酮类抗菌药，但左氧氟沙星主要用于治疗由敏感革兰氏阴性菌以及革兰阳性菌引起的轻中度感染，如扁桃体炎、支气管炎等。而盐酸左氧氟沙星则更适用于敏感细菌引起的轻中度感染，如呼吸系统感染中的急性支气管炎、慢性支气管炎急性发作等，以及生殖系统感染、皮肤软组织感染等。
4、不良反应不同：左氧氟沙星可能引起发烧、皮疹等不良反应，而盐酸左氧氟沙星则可能导致恶心、呕吐、腹部不适等症状。
5、储藏方法不同：在储藏方面，左氧氟沙星通常室温保存即可，而盐酸左氧氟沙星则需要保存在不超过20℃的室内。
在临床使用中，医生会根据具体的病情、患者的个体情况，如年龄、性别、肝肾功能等以及药物的剂型等因素综合考虑选择使用哪一种药物。