甲状腺微创消融术作为一种新型治疗甲状腺疾病的方法，有其优势也存在弊端，而消融不完全、损伤周围组织、恶性肿瘤治疗局限性、存在复发可能都是该手术的局限。
1、消融不完全
- 由于甲状腺组织复杂以及病变多样，微创消融时可能无法确保完全消除所有病变组织。对于较大结节或位置特殊的病变，易出现残留，若消融不完全，病变可能继续生长甚至恶化，需再次治疗，增加患者痛苦和经济负担，也带来心理压力。
2、损伤周围组织
- 甲状腺周围有喉返神经、气管、食管、甲状旁腺等重要结构，操作不当可能损伤这些结构，喉返神经损伤可致声音嘶哑、呼吸困难等严重后果。
- 甲状旁腺损伤会引起低钙血症，出现手足抽搐等症状，尽管医生会尽量避免，但因手术复杂性和个体差异，风险始终存在。
3、恶性肿瘤治疗局限性
- 虽然可用于某些低风险甲状腺微小癌治疗，但对于大多数恶性肿瘤，传统手术切除仍是首选，手术可更彻底切除肿瘤组织并进行淋巴结清扫，降低复发和转移风险，而微创消融术可能无法达到此效果。
4、存在复发可能
- 微创消融术虽能破坏病变组织，但不能完全杜绝复发，患者个体差异、病变性质、术后生活方式等因素都可能影响复发率，复发后患者需再次接受治疗，带来更多困扰。
甲状腺微创消融术具有诸多优点，创伤极小，仅需局部麻醉，通过细针穿刺进行操作，术后几乎不留疤痕，恢复快，患者能在短时间内恢复正常生活和工作。该手术可以精准定位病变组织，对周围正常甲状腺组织和器官影响小，可重复性强。若出现局部复发等情况可再次进行消融，为患者提供了更多的治疗选择。