做胃肠镜检查可能会对人体造成黏膜损伤、出血、穿孔、感染等危害，这些危害的发生率相对较低，且在大多数情况下可以通过规范的操作和及时的处理得到有效控制。
1、黏膜损伤：在进行胃肠镜检查时，内镜可能会对胃肠道黏膜造成一定的损伤，这种损伤通常是轻微的，可能表现为黏膜的擦伤、出血等，如果操作不当或患者的胃肠道较为敏感，损伤的程度可能会加重，一般情况下，轻微的黏膜损伤会在短期内自行修复，但如果损伤较大，可能需要进行相应的治疗。
2、出血：胃肠镜检查过程中，可能会引起胃肠道出血，出血的原因可能是黏膜损伤、血管破裂等，少量的出血一般可以自行停止，但如果出血量较大，可能需要进行止血治疗，如药物止血、内镜下止血等，严重的出血可能会导致贫血、休克等并发症。
3、穿孔：胃肠镜检查存在一定的穿孔风险，穿孔是指内镜穿透胃肠道壁，导致胃肠道内容物泄漏到腹腔内，穿孔的发生率较低，但一旦发生，后果较为严重，可能需要进行紧急手术治疗，以修复穿孔部位，防止腹腔感染等并发症的发生。
4、感染：胃肠镜检查虽然是在无菌条件下进行的，但仍存在一定的感染风险，如果内镜消毒不彻底或患者的免疫力低下，可能会导致细菌、病毒等病原体的感染，感染的部位可能是胃肠道、腹腔等，表现为发热、腹痛、腹泻等症状，需要遵医嘱进行抗感染治疗。
建议选择正规医疗机构，确保设备消毒彻底，医生操作规范，检查前，患者应详细告知医生自己的病史和过敏史，以便医生评估风险，检查后，患者应遵循医嘱，注意饮食和休息，避免剧烈运动。