肛瘘治疗方法多样，除了传统的开刀手术外，还有多种不开刀的治疗方法，如冷冻疗法、内口塞药疗法、电疗仪疗法、药物治疗等。在选择治疗方法时，应根据患者的具体情况和医生的建议进行选择。
1、冷冻疗法
冷冻疗法是利用低温的液氮对肛瘘部位进行凝固性坏死，使坏死后的肛瘘突出部位自然脱落，形成新的创口并完全愈合。操作简单，副作用小，且不会产生其他并发症。适用于低位单纯性肛瘘的治疗，对于高位复杂性肛瘘则效果有限。
2、内口塞药疗法
内口塞药疗法是通过在肛瘘内口处涂抹或塞入药物，如青霉素软膏、红霉素软膏等，以达到消炎镇痛的目的。对于症状较轻的肛瘘患者，能够有效缓解症状，但对于症状较重的患者，可能需要配合其他治疗方法。
3、电疗仪疗法
电疗仪疗法是利用激光将肛瘘部位感染瘘管壁、腐肉等汽化掉，从而达到治疗目的，不出血、能直接灭菌、创伤小、治疗后愈合快，适用于低位肛瘘的治疗。但需要注意的是，电疗仪疗法需要在专业医生的指导下进行，以确保治疗的安全性和有效性。
4、药物治疗
患者可以口服广谱消炎药，如阿莫西林胶囊、头孢克肟片等，配合外用药物如红霉素软膏等，以及高锰酸钾坐浴等方法，以达到清热解毒、消炎镇痛的目的。但需要注意的是，药物治疗仅适用于症状较轻的肛瘘患者，对于症状较重的患者，可能需要配合其他治疗方法。
肛瘘患者还需要注意生活调理，包括忌食辛辣刺激性食物，多食蔬菜、水果，保持大便通畅。养成定时排便的习惯，避免久忍大便。日常保持肛门清洁，便后用温水清洗肛门并保持干燥。