艾灸与针灸的效果优劣各有适应证，不具可比性，需依据病症特点、患者体质等多方面因素综合判定。
- 针灸主要借助针刺穴位，激发经络气血运行，调节人体阴阳平衡。其刺激直接且精准，能迅速疏通经络中阻滞的气血。如对于急性扭伤，针刺扭伤局部及相关经络穴位，可即刻缓解疼痛、改善局部气血瘀滞状况。在治疗一些急性病症，如急性腹痛、落枕等，针灸常能快速起效，通过针刺特定穴位，短时间内调整人体气血，缓解症状。
- 艾灸则是以艾草燃烧产生的温热之力，通过穴位渗透，发挥温通经络、散寒除湿、回阳救逆等功效。对于寒证、虚证效果显著。像因风寒湿邪入侵导致的关节疼痛，艾灸能借助温热刺激，驱散体内寒湿之邪，促进气血流通，减轻疼痛。长期坚持艾灸，还可增强人体阳气。
- 从病症角度看，对于急性、实证，如急性腰扭伤、风热感冒等，针灸的即时疏通经络、调节气血功能更具优势，能迅速缓解症状。而对于慢性、虚寒性病症，像慢性腹泻、宫寒不孕等，艾灸通过长期温养经络、补充阳气，能从根本上改善体质，调节身体机能，效果更为突出。
患者的体质也影响着二者的疗效，体质强壮、气血充足者，对针灸刺激耐受性好，针灸治疗能更好地激发身体调节功能。体质虚弱、阳气不足者，艾灸的温和温养作用更适宜，可避免因针灸的较强刺激损耗正气，通过艾灸慢慢补充阳气，改善身体状态。
艾灸和针灸的注意事项
1、穴位定位准确：艾灸与针灸都需精准定位穴位。艾灸时穴位偏差，难以使温热之力准确作用于经络。针灸穴位不准，无法有效疏通气血。中医师需依病情准确选穴，确保治疗效果。
2、操作手法规范：针灸的进针、行针手法多样，需依病情、穴位特点及患者体质选择，手法不当易引发不适。艾灸时，艾条与皮肤距离、艾灸时间等要控制好，距离过近易灼伤皮肤，时间过长可能导致上火。
3、身体状态适宜：艾灸和针灸时，患者应保持良好身体状态。避免在过度疲劳、饥饿、饱食、醉酒时进行，此时人体气血紊乱，易引发不良反应。身体状态平稳时治疗，效果更佳且安全性高。