水菖蒲和石菖蒲的区别较多，包括来源、性状、气味、功效、治疗疾病等。注意应在专业医生指导下用药，不可擅用，以免危害身体健康。
1、来源
石菖蒲为天南星科植物石菖蒲的干燥根茎。水菖蒲为天南星科植物水菖蒲的干燥根茎；
2、性状
石菖蒲药材呈扁圆柱形，长3-20cm，直径0.3-1cm。表面棕褐色，粗糙，有疏密不均的环节，节间长0.2-0.8cm，具细纵纹、须根痕和圆点状根痕。水菖蒲药材性状与石菖蒲近似，较粗短，长5-15cm，直径1-1.5cm；
3、气味
石菖蒲气芳香；水菖蒲气味特异，味辛；
4、功效
石菖蒲具有豁痰开窍、化湿和胃、宁心益志的功效。水菖蒲具有开窍化痰、健脾、利湿、辟秽杀虫的功效；
5、治疗疾病
石菖蒲用于热病神昏、健忘、失眠、耳鸣、耳聋、风湿痹痛等。水菖蒲用于癫痫、惊悸健忘、神志不清、湿滞痞胀、泄泻痢疾、风湿疼痛、痈肿疥疮等。
在用药之后，需要仔细观察身体表现，如果出现异常，需要立即到专业医院就诊，以确保健康。日常应规律饮食，充分休息，对健康有益。