试管月经第二天的检查项目包括性激素六项、基础窦卵泡计数、子宫内膜厚度评估、血常规和甲状腺功能检查等，这些检查可以全面了解患者的身体状况和生殖功能，为试管婴儿治疗提供重要依据。
1、性激素六项：在月经第二天，通常会进行性激素六项检查，包括促卵泡生成素、促黄体生成素、雌二醇、孕酮、睾酮、泌乳素，这些激素水平的测定可以了解卵巢的储备功能和内分泌状态，为后续的治疗方案提供重要依据。
2、基础窦卵泡计数：通过超声检查可以对基础窦卵泡进行计数，基础窦卵泡数量反映了卵巢中潜在的卵子储备情况，医生会根据窦卵泡的数量来评估卵巢功能，调整促排卵方案，以提高试管婴儿的成功率。
3、子宫内膜厚度评估：月经第二天，子宫内膜处于最薄的状态，此时进行超声检查可以评估子宫内膜的厚度和形态，正常的子宫内膜厚度对于胚胎的着床非常重要，如果子宫内膜过薄或过厚，都可能影响试管婴儿的成功率。
4、血常规检查：血常规检查可以了解患者的血液情况，包括红细胞、白细胞、血小板等指标，这些指标可以反映患者的身体状况，是否存在贫血、感染等问题。在试管婴儿治疗过程中，患者的身体状况需要保持良好，以确保治疗的顺利进行。
5、甲状腺功能检查：甲状腺功能异常可能会影响女性的生殖功能和试管婴儿的成功率，在月经第二天可能会进行甲状腺功能检查，包括促甲状腺激素、游离三碘甲状腺原氨酸、游离甲状腺素等指标的测定。
部分检查项目需要空腹进行，需提前做好准备，检查前一天避免剧烈运动，以免影响检查结果，保持良好的心态，避免过度紧张影响内分泌水平。