扁桃体结石存在自愈的可能性，但并非普遍现象。扁桃体隐窝呈分支状，容易藏污纳垢。当食物残渣等物质进入隐窝后，若不能及时清除，就会被细菌分解，产生难闻气味，并逐渐形成硬块，进而钙化成为结石。
- 对于较小的结石，人体正常的吞咽动作会带动咽喉部肌肉运动，可能使结石位置发生改变，增加排出的机会。同时，咳嗽时产生的气流冲击，也有助于将结石从隐窝中带出。此外，扁桃体自身具有一定的免疫和清洁功能，在免疫力正常的情况下，可对隐窝内的物质进行清理，一定程度上促使结石排出。
- 若扁桃体结石体积较大，超出了扁桃体隐窝的排出能力范围，就很难通过自身生理活动排出。且当结石位置较深，卡在隐窝底部，周围组织包裹紧密时，也不易松动排出。患有慢性扁桃体炎的患者，由于扁桃体长期处于炎症状态，隐窝口可能会出现瘢痕狭窄，影响自洁功能，结石更难排出。此外，一些不良生活习惯，如长期吸烟、饮酒，会削弱口腔和咽喉部的抵抗力，加重扁桃体炎症，使得结石自愈的可能性降低。
- 若扁桃体结石无法自愈，且长期存在，可能会引发一系列问题。结石的持续刺激会导致扁桃体炎症反复发作，出现咽痛、咽干、咽部异物感等症状。而且，结石中的细菌可能会随着吞咽进入消化道，或随着呼吸进入呼吸道，引发其他部位的感染。较大的结石还可能影响吞咽和呼吸功能，给患者带来不适。长期受结石困扰，还可能对患者的心理产生影响，降低生活质量。
对于怀疑有扁桃体结石的患者，应及时就医，通过喉镜等检查明确结石情况。若结石较小，可在医生指导下，通过漱口、使用口腔清洁工具等方法，尝试促进结石排出。对于较大且无法自愈的结石，可能需要医生借助专业工具取出，如镊子、刮匙等，必要时可能需进行扁桃体切除手术。
扁桃体结石的预防措施
1、保持口腔清洁：建议每天至少刷牙两次，每次刷牙时间不少于两分钟，并使用牙线或牙间刷清洁牙齿间隙。同时，使用抗菌漱口水漱口，可以减少口腔内的细菌和食物残渣，降低结石形成的风险。
2、保持口腔湿润：口腔干燥会增加扁桃体结石的形成风险。因此，保持充足的饮水量非常重要，这有助于促进唾液分泌，清洁口腔和扁桃体隐窝。减少酒精和咖啡的摄入，因为这些饮品可能导致口腔干燥。
3、调整饮食习惯：建议选择清淡易消化的食物，多吃新鲜蔬菜和水果，避免食用过多糖分和淀粉类食物，因为这些食物容易滋生细菌。同时，尽量减少食用硬质食物，如坚果和糖果，这些食物容易残留在扁桃体隐窝中。