腘窝囊肿的治疗方法需根据患者的具体情况进行选择，没有绝对的“最佳”方法，常用的治疗方式有保守治疗、手术治疗等。
1、保守治疗：适用于囊肿较小、症状不明显的患者。一般采用休息、减少膝关节活动、局部热敷等方法，以缓解疼痛和肿胀。也可使用非甾体类抗炎药，来减轻炎症和疼痛。此外还可以向关节腔内注射糖皮质激素，以减轻炎症反应，促进囊肿的吸收，但这种方法可能有一定的副作用，如局部皮肤色素沉着、关节软骨损伤等，需谨慎使用。
2、手术治疗：对于囊肿较大、症状明显，如出现疼痛、肿胀影响关节活动，或保守治疗无效的患者，通常考虑手术治疗。手术方式有传统的开放手术和关节镜下微创手术。开放手术视野清晰，能彻底切除囊肿，但创伤较大，恢复时间较长；关节镜微创手术具有创伤小、恢复快、并发症少等优点，但对手术医生的技术要求较高。手术过程中，医生会尽量完整切除囊肿，同时处理可能存在的关节内病变，如半月板损伤、滑膜炎等，以降低囊肿复发的风险。
3、穿刺抽吸和硬化剂注射治疗：适用于不愿意接受手术或身体状况不适合手术的患者。在超声引导下，将囊肿内的液体抽出，然后注入硬化剂，使囊肿壁粘连、闭合，从而达到治疗的目的。这种方法操作相对简单，创伤小，但有一定的复发率，且硬化剂可能会引起局部疼痛、过敏等不良反应。
患者在治疗后应注意休息，避免过度活动膝关节，遵医嘱进行康复锻炼，以促进膝关节功能的恢复。同时要定期复查，观察囊肿是否复发。如果出现不适症状，应及时就医。
腘窝囊肿的预防措施
- 过重的体重会增加膝关节的负担，长期下来可能导致关节问题，包括腘窝囊肿的形成。通过均衡饮食和规律运动，将体重控制在正常范围内，有助于减轻膝关节的压力。
- 运动时佩戴护膝等防护用品，减少膝关节受伤的可能性。避免膝关节受到外力撞击或扭伤，特别是在进行高风险运动时。长时间屈膝或蹲坐会增加膝关节的压力，建议在工作或生活中注意调整姿势，避免长时间保持同一姿势。
- 强化大腿前侧和后侧的肌肉群，如股四头肌和腘绳肌，可以提供更好的膝关节支持，减轻关节压力。可以通过常规的力量训练，如直腿抬高、深蹲等，来增强这些肌肉的力量。