胃肠镜检查所耗费的时间并非固定不变，通常普通胃镜检查大约需要5到15分钟，而普通肠镜检查则大概需要10到30分钟，但实际时长会因多种因素而有所波动。
- 胃肠镜检查时间受患者自身情况影响显著，患者的胃肠道解剖结构是重要因素之一。部分患者胃肠道存在先天或后天的结构异常，如肠道弯曲角度过大、肠腔狭窄等，这会增加内镜通过的难度，延长检查时间。例如，肠道憩室较多的患者，医生需要更加仔细地观察憩室内及周边情况，以排查病变，检查时间可能会延长至40分钟甚至更久。
- 患者在检查过程中的配合程度也至关重要，若患者过于紧张，胃肠道会发生痉挛，使得内镜难以顺利推进，操作时间必然增加。反之，能放松身体、积极配合医生指令进行呼吸调整的患者，检查往往能较为顺畅地进行，耗时也就相对较短。
- 检查目的不同，胃肠镜检查时间也会有很大差异。若只是进行常规体检，医生主要对胃肠道黏膜进行一般性观察，查看有无明显病变，这种情况下，普通胃镜检查一般在5到10分钟内即可完成，肠镜检查多在10到20分钟左右。
- 但若是因患者出现腹痛、便血、消瘦等症状，医生需要进行针对性排查，仔细观察胃肠道黏膜的细微变化，寻找潜在病变，时间便会相应延长。如怀疑患者患有早期胃癌，医生可能会对胃部可疑部位进行反复观察、拍照，甚至取组织进行病理活检，此时胃镜检查时间可能会达到20分钟以上。
医生的操作经验与熟练程度同样会影响检查时长，经验丰富、技术娴熟的医生，对内镜的操控更加精准、灵活，能够迅速且准确地找到病变部位，减少不必要的操作时间。在面对复杂的胃肠道结构或疑难病变时，他们也能凭借丰富的经验及时调整检查策略，高效完成检查。
这类医生进行普通胃镜检查，平均耗时可能在8分钟左右，肠镜检查约15分钟。而经验相对欠缺的医生，在操作过程中可能需要更多时间来熟悉胃肠道结构，应对突发状况时反应速度也可能稍慢，检查时间会有所增加。
胃肠镜检查的注意事项
1、检查前注意事项：胃镜检查前6到8小时需禁食，前2小时禁水，以确保胃内空虚，便于医生清晰观察胃黏膜。肠镜检查前1到2天应进食低渣、易消化食物，如米粥、面条等，检查前4到6小时需服用泻药进行肠道清洁，直至排出的大便呈清水样，以保证肠道内无粪便残留，不影响检查视野。
2、检查后注意事项：检查结束后，患者需在医院留观一段时间，尤其是进行无痛胃肠镜检查的患者，待麻醉药效消退、身体状况稳定后再离开。胃镜检查后2小时内禁食禁水，待咽喉部麻醉作用消失后，可先尝试饮用少量温水，若无不适，再逐渐恢复正常饮食。肠镜检查后，若未进行活检，可正常进食；若取了组织活检，需根据医生建议，短期内进食温凉、易消化的食物，避免剧烈运动，注意观察有无腹痛、便血等异常情况，如有不适，及时就医。