新生儿心脏出现两个小孔未闭合的情况，通常与先天性心脏发育异常有关，例如卵圆孔未闭、动脉导管未闭、房间隔缺损等，还应及时选择合适的方法进行处理。
1、卵圆孔未闭：卵圆孔是胎儿时期心脏房间隔的一个生理性通道，正常情况下，在出生后随着第一声啼哭，左心房压力升高，卵圆孔会逐渐功能性闭合，并在接下来的几个月内完全闭合，对于新生儿来说，卵圆孔未闭属于正常的生理现象，多数会在数月内自然闭合，无需特殊处理。
2、动脉导管未闭：动脉导管是连接肺动脉与主动脉之间的血管通道，在胎儿期起到重要的血液分流作用，出生后，随着肺循环的建立和体循环压力的上升，动脉导管会逐渐功能性闭合，并在数月内完成解剖学上的闭合，若动脉导管持续未闭，可能导致心脏负荷增加，影响新生儿的生长发育，对于动脉导管未闭的治疗，需根据患儿的具体情况和医生建议，可能包括药物治疗或手术治疗。
3、房间隔缺损：房间隔缺损是先天性心脏病的一种，表现为心脏房间隔上存在未闭合的孔洞，可能是由于基因或染色体异常导致的先天性心脏发育缺陷，房间隔缺损的大小和位置决定了其对新生儿的影响程度，部分小型缺损可能随着年龄增长而自行闭合，而大型缺损可能需要手术干预。
4、室间隔缺损：与房间隔缺损类似，室间隔缺损也是先天性心脏病的一种，发生在心室间隔上，室间隔缺损同样可能由遗传因素或胚胎发育异常引起，对新生儿的心脏功能和生长发育产生影响，治疗方案需根据缺损的大小、位置及患儿的具体情况制定。
针对新生儿心脏小孔未闭合的情况，家长应注意保持新生儿的营养充足和作息规律，定期带新生儿进行心脏检查，以监测心脏发育情况，如有任何异常症状或心脏功能受损的表现，应及时就医并遵循医生的建议进行治疗。