女性肾盂肾炎的严重程度因人而异，急性病例及时规范治疗多可痊愈，不算严重；但若延误治疗、反复发作或出现并发症，则较为严重，可能损害肾功能甚至危及生命。早期发现、及时抗感染治疗，同时注意个人卫生、增强抵抗力，是避免病情加重的关键。
急性肾盂肾炎起病较急，主要表现为高热、腰痛、尿频尿急尿痛等尿路刺激症状，部分患者可伴随恶心、呕吐。若能及时明确致病菌，给予规范的抗感染治疗，同时辅以补液、对症支持，多数患者可在1-2周内痊愈，无明显后遗症，此类情况相对不严重，预后良好。
若急性肾盂肾炎未能及时诊治，感染未得到有效控制，病情可能进一步加重，出现严重并发症。常见的并发症包括肾脓肿、肾周脓肿，表现为持续高热、剧烈腰痛，甚至影响肾功能；严重时可引发感染性休克，出现血压下降、意识模糊等，危及生命，此类情况则较为严重。
慢性肾盂肾炎多由急性肾盂肾炎反复发作、治疗不彻底演变而来，病程迁延超过半年，肾脏组织已出现不可逆损伤，可伴随肾功能下降、肾实质瘢痕形成。患者常表现为反复的尿路刺激症状、低热、乏力，长期发展可能导致慢性肾功能不全，增加治疗 难度。
此外，女性特殊生理阶段如妊娠期、绝经后，肾盂肾炎的严重程度可能增加。妊娠期子宫压迫尿路导致尿液淤积，易加重感染，且感染可能影响胎儿发育；绝经后雌激素水平下降，尿道黏膜抵抗力减弱，感染易反复发作，更易进展为慢性，损害肾功能。