艾滋病阻断药的服用疗程为28天，吃了一个疗程后，基本不能再改变结果，但并不代表大局已定。由于艾滋病存在较长的窗口期，且根据检测方法的不同，窗口期也有所不同，建议在全程服完阻断药后2个月，再次进行抽血检查。
HIV(人类免疫缺陷病毒)的复制一般要经过多个阶段，包括HIV进入细胞、在逆转录酶的作用下进行逆转录、在整合酶作用下进行整合，再进行转录、翻译以及包装成熟等过程形成新的病毒颗粒，后者继续感染细胞。
现有的多种阻断药物通过阻止病毒进入细胞以及抑制逆转录酶、整合酶或蛋白酶等HIV复制过程中的关键酶来抑制HIV的增殖，而当HIV的复制过程被药物阻断后，就失去了感染细胞的可能。
因此通常建议在发生暴露行为后72小时内服用艾滋病阻断药，能大大降低艾滋病的感染风险，且越快服用效果越好。
但艾滋病阻断药并不能起到百分百的阻断效果，部分患者即使全程服用阻断药，仍可能发生感染。因此一般建议在服用阻断药后，仍然需要去医院进行抽血化验，以明确是否有造成艾滋病感染。
艾滋病的窗口期一般在1周-6个月不等，如在第3周检测为阴性时，一般建议在第12周再进行复测，最多6周内血液中才可检测到HIV抗体或者HIV抗原。因此建议在吃完艾滋病阻断药后立即去医院进行抽血化验。
若结果为阴性，建议间隔2个月后再次抽血化验，也就是高危行为后3个月复查。若结果仍为阴性，即可排除诊断。