阴茎出现刺痛可能是多种因素所致，常见的是尿道炎、膀胱炎，而龟头炎、附睾炎、尿路结石也有可能出现，不排除阴茎损伤、尿道损伤、淋病的可能。
1、尿道炎：不洁性行为、局部卫生不良、憋尿等因素都可能诱发尿道炎。患者在排尿时会感到明显的刺痛，尤其是在尿道外口附近，有时还会伴有尿道分泌物增多、尿道口红肿等症状。
2、膀胱炎：长期憋尿、饮水过少、免疫力低下等因素容易引发膀胱炎，可能引起阴茎刺痛，尤其是在急性膀胱炎时，炎症刺激膀胱黏膜，可导致下腹部疼痛，同时疼痛可放射至阴茎，还会有尿频、尿急、血尿等症状。
3、龟头炎：不注意个人卫生、包皮过长或包茎等因素容易导致龟头炎，可由细菌、真菌或过敏等因素引起。患者会出现龟头红肿、瘙痒、疼痛等症状，疼痛可放射至阴茎，引起阴茎刺痛。
4、附睾炎：附睾炎虽然主要是附睾部位的炎症，但炎症可蔓延至阴茎，引起阴茎刺痛。患者通常会感到阴囊部位疼痛，疼痛可放射至下腹部及阴茎。
5、尿路结石：如果尿路结石排出过程中经过尿道，可能会引起阴茎刺痛伴有剧烈的腰痛、血尿等症状，较小的结石在排出过程中可能嵌顿在尿道内，刺激尿道黏膜，导致阴茎刺痛。患者会感到突然的疼痛，疼痛程度较为剧烈。
6、阴茎损伤：外力撞击、过度手淫、性生活过于剧烈等，都可能会造成阴茎海绵体破裂或白膜损伤，患者会立即感到剧烈的疼痛，阴茎肿胀淤血，同时伴有刺痛感。
7、尿道损伤：尿道内插入异物、导尿操作不当等可能导致尿道损伤，出现阴茎刺痛，同时可能伴有血尿。
8、淋病：淋病是由淋球菌感染引起的性传播疾病，主要症状包括尿道口灼痛、红肿，伴有脓性分泌物，可引起阴茎刺痛。
建议保持局部清洁，清洗时要将包皮完全翻开，彻底清洗包皮垢，使用温和的肥皂或专用的清洁剂，避免使用刺激性强的洗液。勤换内裤，选择宽松、透气的棉质内裤，保持局部干燥。