通常情况下会厌囊肿不会自动消失，但也存在部分特殊情况，患者需要注意观察自身情况，可以前往医院耳鼻喉科就诊，明确诊断后，在医生指导下进行针对性治疗。
- 在极少数情况下，如果会厌囊肿体积积小，且患者没有明显的不适症状，仅在喉部检查中偶然发现，囊肿有可能会自动消失。通常发生在囊肿内的液体自行吸收或囊肿周围发生轻微炎症反应后，囊肿逐渐缩小甚至消失，此种情况较为罕见，且即使囊肿暂时消失，也存在复发的可能性。
- 大多数情况下，会厌囊肿不会自动消失，尤其是当囊肿体积较大时，可能会刺激咽喉部位，引起咽部异物感、吞咽困难、呼吸困难等症状。此时，囊肿内的黏液或胶冻样物质往往无法自行排出，导致囊肿持续存在并逐渐增大，如果不进行干预治疗，可能会对患者的日常生活和工作造成严重影响。
- 会厌囊肿的形成与多种因素有关，包括先天性发育畸形、慢性喉炎、机械刺激等，上述因素导致会厌黏膜的黏液腺管受阻，黏液无法正常排出，从而在局部积聚形成囊肿。由于上述形成原因往往难以完全消除，因此囊肿很难自行消失。
一旦确诊会厌囊肿，患者应根据医生的建议进行积极的治疗和复查，治疗方法主要包括药物治疗、穿刺抽液和手术切除等，患者还应注意保持良好的生活习惯和饮食习惯，减轻咽喉部的不适症状并预防囊肿的复发。