Ⅱ型呼吸衰竭是一种较为严重的呼吸功能障碍状态，诊断有明确的标准，需由专业综合考虑血气分析指标、临床表现等。
1、血气分析指标：血气分析是诊断Ⅱ型呼吸衰竭的关键，主要依据动脉血中的氧气分压和二氧化碳分压的数值。在海平面、静息状态、呼吸空气的条件下，PaO₂<60mmHg，同时PaCO₂>50mmHg，即可诊断为Ⅱ型呼吸衰竭。
2、临床表现：患者常表现出呼吸困难，可呈浅快呼吸或呼吸节律改变，还会有发绀现象，即口唇、甲床等部位呈现青紫色。患者可能出现神经精神症状，如头痛、烦躁不安、嗜睡甚至昏迷等，这些表现可辅助诊断II型呼吸衰竭。
3、原发病因：Ⅱ型呼吸衰竭多由慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘等呼吸系统疾病发展而来，如慢性阻塞性肺疾病患者由于气道阻塞逐渐加重，导致通气功能障碍，引起二氧化碳潴留，进而发展为Ⅱ型呼吸衰竭，对原发病因的分析有助于诊断。
4、病情进展评估：随着病情的进展，患者的呼吸功能会进一步恶化。早期可能仅在活动后出现呼吸困难等症状，逐渐发展到安静状态下也有明显的呼吸窘迫。患者血气分析指标也会发生变化，二氧化碳分压进一步升高，氧气分压持续降低。
5、辅助检查结果：胸部影像学检查如胸部X线、CT等，可以帮助发现肺部的基础病变。如在慢性阻塞性肺疾病患者中，可能会看到肺纹理增多、紊乱，肺气肿征象等。肺功能检查可以评估患者的通气功能障碍程度，对诊断Ⅱ型呼吸衰竭及判断病情严重程度有重要意义。
临床上需要与其他类型的呼吸功能障碍相鉴别，如I型呼吸衰竭主要是缺氧而无二氧化碳潴留，与Ⅱ型呼吸衰竭的血气分析特点不同。而心源性疾病导致的呼吸困难等症状也需要与Ⅱ型呼吸衰竭鉴别，可通过综合分析进行准确诊断。