电子胃十二指肠镜是临床消化内科常用的检查及诊断工具，其主要作用是检查食管、胃部、十二指肠位置有无异常病变。
1、食管
该部位向下连接胃部，电子胃十二指肠镜从该处进入后，可观察食管黏膜处有无充血、水肿等炎症性改变，以及有无息肉类增生物，适用于反流性食管炎等的检查；
2、胃部
经由胃贲门处进入胃囊袋内，可观察胃部黏膜有无损伤，胃壁血管有无破裂、出血现象，适用于出现胃痛、胸腹部有烧灼痛者，如急慢性胃炎、胃溃疡等疾病；
3、十二指肠
电子胃十二指肠镜经胃部向下继续进入，可到达十二指肠，可以观察有无炎症、溃疡、增生性赘生物，以及有无未完全吸收的食糜，解剖结构是否有异常，或是肠腔粘连、畸形等。
除了检查之外，还可以通过内镜进行治疗，比如赘生物的切除，电凝止血或是取出异物等，而且具有创伤小，痛苦程度轻微，恢复速度较快等优点。
但是需注意，并不是所有人群都适合进行电子胃十二指肠镜检查，有一定风险存在。检查者需要进行心电图、凝血功能等检查，有心脏病、消化道急性穿孔等疾病以及身体过于虚弱 者，不建议行该项目，以免引起不良后果。可适应检查者需空腹，避免食物等消化道内容物遮挡镜面，影响结果的诊断。