甲沟炎去医院可以挂多个科室，常见的有皮肤科、普外科、手足外科、急诊科，以及感染科、内分泌科。
1、皮肤科：主要看皮肤、黏膜、指甲、趾甲、毛发及性传播方面的疾病，甲沟炎作为指甲或趾甲与周边软组织连接部位出现的炎症，属于皮肤科的治疗范畴。
2、普外科：可以看甲状腺、乳腺、肝、胆、胰、脾、肾等部位的外科疾病，对于甲沟炎患者，普外科医生可以对局部进行消炎清洗治疗，出现脓肿者，还可对局部进行切开引流。
3、手足外科：主要看手和脚部位的疾病，包括手部、脚部骨折，腱鞘炎、手足口病、甲沟炎、手指畸形等，如果当地医院级别较高，科室分得较细，可以选择此科室进行治疗。
4、急诊科：如果甲沟炎引起剧烈疼痛的症状，或者病情比较严重，出现大面积脓肿、溃烂、渗出等现象，甚至引起高热、寒战等症状，可以直接到急诊科进行治疗。急诊科医生能够较快地选择治疗方案，从而减轻患者机体不适症状。
5、感染科：由于甲沟炎通常是由于感染病原微生物引起，通过在感染科检查，能够明确病原微生物类型，从而进行对因治疗。
6、内分泌科：如果自身患有糖尿病，长期血糖高得不到及时的控制，容易造成微血管病变，诱发甲沟炎。此时应去内分泌科就诊，以便诊断以及治疗疾病。
具体科室的选择可能因医院设置和病情严重程度而异，建议患者在就医前咨询医院工作人员，以便得到更准确的指导。