耳朵发炎流脓通常难以自愈。耳朵发炎流脓往往是细菌感染的表现，外耳道炎、中耳炎等疾病都可能导致这种情况。外耳道皮肤具有一定的防御功能，但当细菌毒力较强或者局部环境改变时，细菌就会大量繁殖引发炎症。一旦出现流脓现象，说明炎症已经较为严重，细菌在耳道内持续产生有害物质并破坏周围组织。
- 中耳腔通过咽鼓管与鼻咽部相通，本身结构较为复杂。当中耳炎引发流脓时，炎症可能已经累及中耳的黏膜、骨质等结构。中耳内的脓液如果不能及时排出和得到有效控制，会导致炎症迁延不愈，进一步可能引起听力下降等严重后果。
- 对于外耳道炎导致的发炎流脓，外耳道的特殊结构使得脓液排出可能不畅。外耳道并非笔直的通道，而是存在弯曲，这会阻碍脓液依靠自身重力等自然排出。同时，外耳道皮肤的炎症会导致局部充血、肿胀，进一步影响脓液的排出，从而使炎症持续存在。
- 在儿童中，耳朵发炎流脓更不容易自愈。因为儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，抵抗细菌感染的能力相对较弱。而且儿童的咽鼓管较成人短、平、宽，细菌更容易从鼻咽部进入中耳，引发中耳炎并流脓，如不进行治疗，病情容易加重。
耳朵发炎流脓如果长期不愈，还可能引发其他并发症，例如炎症可能扩散到周围组织，引起乳突炎等疾病。乳突是位于耳后的骨质结构，炎症一旦累及此处，治疗会更加复杂，可能需要手术干预才能治愈。所以，耳朵发炎流脓一般需要医疗干预来控制感染、促进愈合。