牛黄解毒指的是牛黄解毒片，三黄指的是三黄片。这两种药物的主要区别在于药物组成不同、功效和主治不同、不良反应不同，以及禁忌证不同。
1、药物组成不同
牛黄解毒片主要包括人工牛黄、雄黄、石膏、大黄、黄芩、桔梗、冰片、甘草等。三黄片主要材料为大黄、盐酸小檗碱、黄芩浸膏，辅料为淀粉、硬脂酸镁等；
2、功效和主治不同
牛黄解毒片具有清热解毒的功效，主要用于治疗火热内盛引起的咽喉肿痛、牙龈肿痛、口舌生疮，以及目赤肿痛。三黄片具有清热解毒，泻火通便的功效，主治三焦热盛引起的目赤肿痛、口鼻生疮、咽喉肿痛、牙龈肿痛、心烦口渴、尿黄便秘等；
3、不良反应不同
牛黄解毒片的不良反应主要为便血、皮肤药疹，三黄片不良反应有恶心、呕吐等；
4、禁忌证不同
虚火上炎所致口疮、牙痛、喉痹者、脾胃虚弱者慎用牛黄解毒片，孕妇、儿童、年老体弱以及脾胃虚寒者禁用三黄片。
患者在服用两种药物治疗疾病时，一定要在医生指导下应用，不要擅自服用，以免引起身体不良反应。