益生菌一般不会导致便秘，因为益生菌在肠道中发挥着重要的调节作用，有助于维持肠道菌群的平衡和功能的正常。但是在服用益生菌时也需要注意适量、适时、适种的原则，以充分发挥益生菌的健康益处。
- 益生菌是对人体健康有益的活性微生物，主要寄生于人体的肠道内，可以通过调节肠道菌群平衡，对肠道的健康会产生深远影响。而且益生菌能够增强肠道的蠕动功能，通过代谢产生短链脂肪酸等有益物质，这些物质能够刺激肠道平滑肌的收缩，促进肠道内容物的推进，从而缩短粪便在肠道内的停留时间，减少水分被过度吸收，有效预防便秘的发生。
- 同时，益生菌还能够抑制有害菌的生长。肠道内的有害菌在数量过多时，会破坏肠道菌群的平衡，产生有害物质，损害肠道黏膜，甚至会引发肠道炎症。而且益生菌通过竞争营养、占据生态位等方式，有效抑制有害菌的繁殖，维护肠道的健康，减少便秘等肠道问题的发生。
- 益生菌还能够促进营养物质的吸收和利用。益生菌能够分解食物中难以消化的成分，如纤维素等，可以使其转化为易于吸收的营养物质，供身体利用。同时，益生菌还能够合成维生素等对人体有益的物质，进一步促进身体健康。
但是每个人的肠道菌群组成和肠道功能都有所不同，对益生菌的反应也可能存在差异。有些人的肠道可能对某些益生菌比较敏感，或者在服用益生菌后，肠道菌群的调整过程中出现了一些暂时的不适应。