泮托拉唑的用药时长需根据具体疾病和医生指导调整，通常短期治疗为4-8周，长期使用需定期评估风险。 泮托拉唑作为质子泵抑制剂，其核心作用机制是通过特异性抑制胃壁细胞H⁺-K⁺-ATP酶活性，阻断胃酸分泌的最后环节，从而降低胃内酸度。
对于急性胃溃疡或轻度反流性食管炎患者，短期治疗周期通常设定为4-8周，这一阶段的治疗目标在于快速缓解症状、促进黏膜愈合，例如，胃溃疡患者经4周规范治疗后，内镜复查溃疡愈合率较高，但停药前必须通过胃镜复查确认黏膜愈合状态，避免因过早停药导致溃疡复发。
当患者存在Barrett食管、卓-艾综合征等需要长期抑酸治疗的疾病时，用药周期可能延长至数月甚至数年，此时需建立动态评估机制，每3-6个月监测血镁水平、肾功能及肠道菌群状态。长期PPI使用可能引发低镁血症、骨质疏松风险增加及艰难梭菌感染等不良反应，因此定期评估尤为重要。
此外，患者需特别注意，不可因症状暂时缓解而擅自停药，也不应无指征地长期服用。建议建立用药日记，记录服药时间、症状变化及不良反应，为医生调整方案提供依据。