一觉醒来上颚痛，且吞口水时疼痛加重，可能由多种原因引起，如空气干燥、上颚黏膜溃疡、疱疹性咽峡炎等。
1、空气干燥：睡觉时室内空气过度干燥或者张口呼吸，导致口腔分泌物减少。注意多喝水，保持室内湿度适宜，尽量避免张口呼吸。
2、饮食不当：因经常进食辛辣刺激食物，可引起口干舌燥，咽喉肿痛等不适。应注意多喝水，保持口腔湿润。调整饮食，减少辛辣食物摄入，必要时可服用清热解毒中药。
3、急性咽炎：可能是致病菌侵袭咽部黏膜引起炎症，会引发嗓子干痛、口腔以及咽喉肿痛，严重时伴有咽痛剧烈等症状。需要在医生指导下进行抗炎治疗，可使用青霉素、头孢类药物等。
4、上颚黏膜溃疡：进食辛辣刺激、过烫、过硬等食物后，造成上颚黏膜擦伤形成溃疡，表现为上颚溃疡处疼痛，并且在吞咽口水时疼痛加重。在医生指导下使用含有杀菌成分的含漱液，同时可以使用喷剂药物喷涂患处缓解。
5、疱疹性咽峡炎：主要因疱疹病毒侵袭咽峡炎部位引起炎症，也可能导致上颚疼痛，并在吞咽时加重。根据具体疾病进行相应治疗，如使用口腔溃疡散、抗病毒药物等。
如果疼痛持续不减或加重，建议及时到医院就诊，进行相关检查以明确病因。避免食用辛辣刺激、过烫、过硬的食物，以免加重症状。注意口腔卫生，定期刷牙漱口，避免口腔感染。在医生的指导下进行药物治疗，不要自行随意用药。