青海虫草和那曲虫草在产地、生长环境、外观、气味、产量都存在一定的差异。消费者在购买时，可以根据自己的需求和喜好进行选择。
1.产地
青海虫草主要产于青海省的玉树、果洛、黄南、海南、海北等州，而那曲虫草则生长在西藏那曲地区海拔4500-6000米以上的羌塘草原上；
2.生长环境
从生长环境来看，虽然两者都属于高寒地区，但那曲的海拔更高，生长环境更为寒冷；
3.外观
青海虫草以色泽褐黄、肉质肥厚、菌座短而粗壮为特点，质量在青海虫草中品相最好。而那曲虫草则以其色泽黄亮、虫体更偏黄一点、虫体部分更膨松而著称。在个头大小上，虽然两地海拔高度基本一致，但同等规格下那曲虫草显得稍大一点，而青海虫草则更紧实饱满；
4.气味
青海玉树杂多虫草的气味闻起来有一种浓郁的类香菇味，相对于那曲虫草来说更浓一些。那曲虫草则不同，带有一种浓酥油的香味；
5.产量
青海省的冬虫夏草年产量高，而西藏那曲的虫草产量相对较少，仅占全国的5%左右。
青海虫草和那曲虫草在药用价值上没有太大区别，都具有补肺益肾、补精髓、止血化痰等功效，适用于肺肾两虚、精气不足、咳嗽气短、自汗盗汗、腰膝酸软、阳痿遗精、劳嗽痰血等病证。同时，两者都含有丰富的营养成分，对人体具有一定的保健作用，但均需要在医生指导下使用。