在大多数常规的肛门镜检查情况下，需要进行一定程度的肠道准备的，适当清肠有助于提高检查的准确性和可靠性。
- 清肠后，肠道内的粪便残渣减少，视野会更加清晰。医生能够更清楚地观察肛门、直肠黏膜的状态，包括是否有炎症、溃疡、息肉、肿瘤等病变。如果肠道内有较多粪便残留，可能会遮挡病变部位，导致漏诊一些潜在的问题，比如较小的直肠息肉或者早期的黏膜病变可能被粪便掩盖而难以被发现。
- 但是在一些特殊情况下，清肠可能不是必需的，例如当患者因为紧急情况需要进行肛门镜检查，如急性肛周疼痛、便血严重且怀疑是肛门局部病变导致，而此时没有足够的时间进行常规的清肠准备。这种情况下，医生可以在尽量清洁肛门局部后进行检查，重点关注肛门及直肠下段的明显病变。
- 如果患者身体状况较差，如存在严重的心肺疾病、年老体弱等，无法耐受清肠过程，或者因为某些原因不能进行常规的肠道准备，医生也会根据实际情况权衡利弊。可能会进行简单的局部清洁后就进行肛门镜检查，虽然检查视野可能会受到一定影响，但可以先对肛门及直肠局部的明显异常进行初步评估。
在进行肛门镜检查前，患者应与医生充分沟通，医生会根据患者的具体情况，包括病情的紧急程度、身体状况、检查的目的等，来决定是否需要清肠以及采取何种肠道准备措施。