布拉氏酵母菌散不建议长期服用。它属于药物，具体使用应在专业医生的指导下进行，不可擅自使用。
布拉氏酵母菌是一种益生菌，存在于肠道内，可以调节各种原因引起的消化不良和菌群失调。虽然可以治疗儿童、成人的急性感染或非特异性炎症，且不良反应较少，但是并不需要长期服用。
布拉氏酵母菌散的治疗疗程通常在2周左右，如果腹泻症状没有得到缓解，可以继续服用5-7天。症状缓解后，对于慢性肠道菌群紊乱或慢性腹泻，可以适当服用2-5天。长期服用可能会破坏肠道内正常的菌群平衡，反而不利于健康。
此外，服用布拉氏酵母菌散时，不要与开水、冰水或含酒精的饮料混合，以免影响药效。同时，它可以和抗生素如头孢克肟片一起服用，但如果是胶囊药物，应整粒吞服。对于有鼻饲管的患者，可以将药物与制备的营养液一起混匀服用。