脑干损伤是一种较严重的神经系统损伤，根据其损失部位和严重程度，其临床表现复杂多样，主要包括意识障碍、瞳孔和眼球运动变化、去大脑强直等。
1、意识障碍：原发性脑干损伤患者伤后立即出现昏迷，且昏迷持续时间长，程度深，恢复慢，甚至可能持续昏迷不醒。即使意识恢复后，也可能伴有智力减退和精神症状。继发性脑干损伤会随着损害的进一步加重，患者可能表现出嗜睡、昏迷或睡眠觉醒周期紊乱等意识障碍。
2、瞳孔和眼球运动变化：中脑损伤时，可能出现两侧瞳孔大小不等、大小变化不定。脑桥损伤时，瞳孔可能极度缩小，光反射消失。
3、去大脑强直：是中脑损伤的重要表现之一，主要表现为伸肌张力增高，两上肢过伸并内旋，下肢亦过度伸直，头部后仰呈角弓反张状。
4、交叉性瘫痪：脑干一侧损伤时，常出现交叉性瘫痪，即病灶侧脑神经麻痹和对侧肢体瘫痪。
5、呼吸紊乱：当该脑干受损时，呼吸中枢的功能发生紊乱，无法正常调节呼吸，导致呼吸急促、呼吸困难、喘息等症状。
脑干损伤还可能引起其他症状，如头痛、头晕、恶心、呕吐等颅内压增高的表现。颅神经受损时，还可能出现面部感觉减退、面瘫、伸舌偏斜、吞咽困难、饮水呛咳、声音嘶哑、构音障碍等症状。部分患者还可能出现消化道出血、顽固性呃逆等内脏症状。一旦出现这些症状，应立即就医并接受专业治疗。