甲状腺炎有效的治疗方式有疼痛管理、甲亢或甲减控制、免疫调节治疗等，甲状腺炎最佳的治疗方法需要根据甲状腺炎病情严重程度从诸多方式中选择最佳方法，具体可就诊甲状腺外科或相关科室明确病因后对症最佳治疗。
1、饮食调整：根据甲状腺功能调整碘的摄入。避免高碘食物，保持营养均衡，多吃富含维生素和矿物质的食物。
2、休息与运动：保证充足的休息，避免过度劳累。适当进行运动，增强体质，提高免疫力。
3、疼痛管理：对于亚急性甲状腺炎等有疼痛症状的患者，可使用非甾体抗炎药，如布洛芬类药物缓解疼痛，若疼痛严重，可使用糖皮质激素，但应注意其副作用。
4、甲亢与甲减控制：若甲状腺炎引起甲状腺功能亢进，可使用β受体阻滞剂类药物控制心悸、多汗等症状，但应避免使用抗甲状腺素类药物，以免加重甲减，甲减治疗若出现甲状腺功能减退，需补充甲状腺激素，并根据甲状腺功能调整剂量。
5、免疫调节治疗：自身免疫性甲状腺炎可考虑使用免疫调节剂，但目前疗效尚不确切。同时应避免过度治疗，以免引起医源性甲亢或甲减。
甲状腺炎患者可能因病情出现焦虑、抑郁等情绪，应及时进行心理疏导，保持良好的心态。甲状腺炎的治疗应综合考虑病情、患者个体差异等因素，选择最佳的治疗方法，同时定期复查甲状腺功能和超声等检查，以便及时调整治疗方案。