少数情况下，肛瘘可能在特定条件下自行恢复，但大多数情形中，由于肛瘘的特殊病理结构以及人体自身修复机制的局限性，往往难以实现自愈，常需借助医疗干预来促进痊愈。
1、低位单纯性肛瘘
若肛瘘形成时间较短，瘘管较为表浅、笔直且内口较小，患者自身抵抗力较强，通过保持肛门局部清洁，使瘘管内炎症得到一定控制，肉芽组织有可能逐渐生长将瘘管填满而自愈。但这一过程长且不确定，期间随时可能因局部感染加重而使自愈进程中断，仍会反复出现肛门肿痛、流脓等症状。
2、高位复杂性肛瘘
这类肛瘘瘘管位置高、分支多且常穿越肛门括约肌，其复杂的结构导致炎症难以彻底消除，感染极易反复，几乎不可能自愈。患者通常会长期遭受较为严重的肛门坠胀、疼痛，瘘口持续有脓性分泌物排出，还可能伴有发热等全身症状，并且随着时间推移，可能引发严重并发症。
患者切不可抱有侥幸心理等待自愈，务必尽快就医，接受专业的肛肠检查，如肛门指诊、直肠腔内超声等，以明确肛瘘的类型与病情程度。在日常生活中，要注意肛门卫生，排便后用柔软且干净的湿巾或温水轻轻擦拭，避免过度用力，以免加重肛瘘症状。
如何促进肛瘘恢复
- 注重肛门护理，每日进行温水坐浴，水温控制在40-45℃，每次坐浴15-20分钟，可促进肛门局部血液循环，减轻炎症与疼痛。坐浴后用柔软干净的毛巾轻轻擦干，保持肛门干燥。避免穿紧身、不透气的内裤，选择棉质、宽松的款式，减少对肛门的摩擦与闷热刺激。
- 调整膳食结构，增加富含维生素与膳食纤维食物的摄入，如新鲜蔬菜、水果、全谷物等，有助于软化大便，减少排便时对肛瘘的刺激。适量摄取优质蛋白质，如瘦肉、鱼类、蛋类等，为身体修复提供原料。避免食用辛辣、油腻、生冷食物，这些食物易引发肠道不适，加重肛瘘病情。
- 在医生指导下，可使用一些消肿止痛、促进创面愈合的药物。如局部涂抹含有中药成分的药膏，能起到消炎、收敛作用；存在感染的情况，可以合理应用抗生素控制感染，但务必遵循医嘱，不可自行滥用药物，以免产生耐药性或引发不良反应。