女性肾盂肾炎多数能治好，急性病例及时规范治疗可实现临床治愈，预后良好；慢性病例因肾脏不可逆损伤，难以彻底根治，但可通过综合治疗控制病情、保护肾功能。早发现、早治疗，严格遵循医嘱用药、定期复查，同时做好个人卫生，能显著提升治愈概率，避免病情迁延加重。
急性肾盂肾炎起病急，以高热、腰痛、尿频尿急尿痛为典型表现，部分伴随恶心呕吐，病因多为单一致病菌感染，病情相对单纯。若能及时就医，通过尿常规、尿培养明确致病菌后，给予规范足量的抗感染治疗，辅以补液、休息、对症支持，多数患者可在1-2周内痊愈，尿液检查恢复正常，无肾脏组织不可逆损伤，达到临床治愈。
急性肾盂肾炎的治愈关键在于早期干预和规范治疗，若延误诊治、用药不规范或擅自停药，感染可能持续存在，反复迁延，进而演变为慢性肾盂肾炎，增加治愈难度。此类情况多因致病菌未被彻底清除，长期刺激肾脏，逐渐导致肾实质瘢痕形成、肾功能轻度损伤，治疗周期会明显延长，且难以实现完全根治。
慢性肾盂肾炎病程迁延超过半年，肾脏组织已出现不可逆损伤，临床主要表现为反复的尿路刺激症状、低热、乏力，部分 患者伴随肾功能下降。其治疗核心并非彻底治愈，而是控制感染、缓解症状、保护肾功能，减少急性发作次数，避免病情进一步进展为慢性肾功能不全。
女性特殊生理阶段会影响治疗效果，妊娠期子宫压迫尿路导致尿液淤积，易加重感染，治疗需兼顾母体安全与胎儿健康，规范用药后多数可控制病情；绝经后雌激素水平下降，尿道黏膜抵抗力减弱，感染易反复发作，需长期做好护理，配合间断抗感染治疗，降低复发风险。