吃甲钴胺可能会出现消化道反应、神经感觉的异常，还可能会出现过敏反应等副作用。对于外周神经疾病患者来说，甲钴胺属于内源性的辅酶B12。
如果是正常遵医嘱服用甲钴胺，可以营养神经、促进神经恢复，还可以促进核酸的合成和叶酸利用，修复损伤的神经髓突或轴突，同时也可以滋养神经细胞，让其慢慢恢复。
但是如果长期盲目使用甲钴胺，可能会出现一些神经感觉不良反应。比如走路不稳、手脚麻木、反应迟缓等，严重时还会出现厌食、恶心等不良反应。长时间使用甲钴胺后，可能会出现腹胀、呕吐、腹泻等消化道反应。
临床上甲钴胺可用于治疗周围神经病和因缺乏维生素B12引起的巨细胞贫血等，但近年来国内医学期刊也报道出甲钴胺多种不良反应。
其中主要有面部红肿、丘疹、荨麻疹、低血糖晕厥、呼吸心跳停止、神经性水肿、双下肢震颤、月经失调等，提示临床应重视甲钴胺不良反应的危害性。
因此，在应用的过程中，一定要结合实际情况慎重选用。对需要用到甲钴胺治疗的患者，需要好好掌握甲钴胺的适应证和禁忌证，确保用药的安全性，以免产生不良影响。