阴囊毛囊上起凸起小疙瘩可能是生理因素引起的，也可能由毛囊炎、尖锐湿疣、传染性软疣等病理因素引起，若小疙瘩持续存在、有异常症状或有不安全性行为史，应及时就医诊断并治疗。
1、生理因素
- 阴囊皮肤有丰富的毛囊，有时毛囊本身比较明显，看起来像小疙瘩，尤其是在毛发比较粗硬或者皮脂腺分泌相对旺盛的男性身上，这种正常的毛囊凸起可能会更加明显，这些小疙瘩通常大小均匀，分布较为规则，没有红肿、疼痛、瘙痒等不适症状。
2、病理因素
- 毛囊炎：当阴囊部位的毛囊受到搔抓、摩擦、局部卫生不良等因素影响时，皮肤的屏障功能被破坏，细菌容易侵入毛囊并引发炎症；真菌感染也可能导致阴囊毛囊炎，多发生在多汗、肥胖或长期使用抗生素、糖皮质激素等导致局部菌群失调的人群中。初起时为与毛囊口一致的红色充实性丘疹或由毛囊性脓疱疮开始，以后迅速发展演变成丘疹性脓疱，中间贯穿毛发，四周红晕有炎症，继而干燥结痂，患者常有局部疼痛、瘙痒等症状。
- 尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染引起，主要通过性接触传播，阴囊部位的皮肤黏膜比较脆弱，在性接触过程中如果感染了HPV，病毒会在阴囊毛囊及周围组织细胞内复制、增殖，导致细胞异常增生，形成疣体。初起为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、菜花样或蕈样突起，患者一般无明显自觉症状，少数可有异物感、灼痛、刺痒或性交不适等。
- 传染性软疣：由传染性软疣病毒感染所致，可通过直接接触，如性接触、皮肤接触或间接接触，如共用毛巾、衣物等传播。典型的皮损为直径3-5毫米大小的半球形丘疹，呈灰色或珍珠色，表面有蜡样光泽，中央有脐凹，内含乳白色干酪样物质，数目不等，可单个发生，也可多个散在分布，一般无自觉症状，少数可有轻微瘙痒。
可以每天用温水清洗阴囊部位，避免使用过热的水或刺激性强的清洁剂，如肥皂等，以免破坏皮肤的屏障功能，清洗后用干净柔软的毛巾轻轻擦干，防止水分残留滋生细菌或真菌。