小三阳患者在进厂体检中是否能通过，取决于多个因素。一般情况下，对于大多数普通工厂的入职体检，小三阳患者有较大可能通过体检。一般来说用人单位在招用人员时，不得将乙肝病毒血清学指标作为体检标准，禁止用人单位以携带乙肝表面抗原为理由拒绝招用或者辞退乙肝表面抗原携带者。只要小三阳患者的肝功能正常，没有其他不符合岗位要求的疾病或异常情况，通常可以顺利通过工厂的入职体检。
从医学角度来看，小三阳是乙肝病毒感染的一种状态，乙肝小三阳患者体内的乙肝病毒复制相对不活跃，传染性通常较低。如果患者定期进行体检，病情稳定，肝功能正常，身体一般不会有明显的不适症状，也不会影响正常的工作和生活。在很多工厂的工作岗位上，小三阳患者完全有能力胜任工作任务，不会因为乙肝小三阳的状态而对工作造成不良影响。
但是也有一些特殊情况可能会影响小三阳患者通过体检。如果工厂的工作性质特殊，对员工的身体健康要求非常高，可能会对小三阳患者的入职有一定限制，比如食品加工 行业，由于涉及食品安全问题，可能会对患有某些传染病的人员入职有更严格的要求。如果小三阳患者在体检时发现肝功能异常，或者伴有其他肝脏疾病的症状，如黄疸、肝区疼痛等，可能会被认为不适合从事某些工作岗位，从而影响体检结果。