对于扁平疣不存在最简单的自愈方法，虽然部分患者可能靠自身的免疫能够达到自愈，但多数患者需要进行生活习惯调整、局部护理、外用药物治疗、口服药物治疗、物理治疗等，促进病情恢复。
1、生活习惯调整
日常生活中患者可以积极进行运动锻炼，保持合理的饮食结构，避免吃辛辣刺激性食物，同时需要避免熬夜，保证充足的休息时间，注意毛巾、脸盆等生活用品的暴晒、消毒，不和他人共用。
2、局部护理
日常生活中不要反复触摸或者抓绕疣体，保证局部皮损处清洁干燥，避免造成人为的扁平疣扩散。
3、外用药物治疗
患者可以遵医嘱在扁平疣的疣体部位涂抹咪喹莫特乳膏、维A酸乳膏、阿达帕林凝胶、重组人干扰素α2b乳膏等抗病毒、调节免疫的药物进行治疗。
4、口服药物治疗
患者可以在医生指导下口服转移因子口服溶液、胸腺肽肠溶片等调节免疫的药物治疗扁平疣。
5、物理治疗
如果扁平疣的疣体相对比较大，但数量较少，单纯用药物难以起效，可采用激光治疗、电离子治疗或液氮冷冻治疗来去除。
除了以上方式外 ，若患者皮肤扁平疣数量较多且较大，则可以由医生进行手术切除。
扁平疣是由人乳头瘤病毒感染皮肤所致，是疣的一种，多发生在面部、手背及前臂等部位，在发病后建议及时到医院皮肤科就诊，明确诊断后按医生要求积极治疗。