大便总是感觉拉不干净与多种疾病有关，包括直肠炎、痔疮、肠易激综合征、直肠息肉、直肠癌等，如果长期存在大便拉不干净的情况，应尽快就医。
1、直肠炎：直肠黏膜发炎时，炎症刺激直肠神经末梢，不断向大脑传递排便信号。即便肠道内粪便已基本排空，异常的神经刺激仍会让人觉得还有大便未排出。直肠黏膜的炎症还可能导致直肠黏膜充血、水肿，影响粪便的正常通过，从而加重排便不净的感觉。
2、痔疮：内痔发展到一定程度，会在肛门内部形成痔核。痔核可刺激肛门周围的神经，产生排便感，痔核会占据一定的直肠空间，阻碍粪便顺利排出，使得部分粪便残留，造成大便总是拉不干净的错觉。
3、肠易激综合征：肠道可能会出现痉挛性收缩，导致粪便在肠道内的推进不规则。部分粪便会滞留在肠道内，即使已经排便，仍会感觉有大便未排尽，肠易激综合征还可能引起肠道对粪便的敏感性增加，即使少量粪便也会产生强烈的排便感觉。
4、直肠息肉：息肉在直肠内形成肿物，占据一定的空间，使粪便通过时受到阻碍，息肉对直肠壁的刺激类似于炎症刺激，会引起神经反射，让大脑接收到持续的排便信号，即使排便过程已经完成，患者依然会觉得大便拉不干净，需要再次排便。
5、直肠癌：肿瘤在直肠内生长，不仅会阻塞肠道，使粪便排出困难，而且癌细胞还会侵犯直肠周围的神经组织，会干扰神经传导，造成排便反射异常，不断产生排便冲动。即使肠道内已无太多粪便，患者也会感觉大便总是拉不干净。
就医时准确描述症状，包括是否有便血、腹痛等伴随症状，可能需要进行直肠指检、肠镜等检查以明确病因。在未明确病因前，避免自行使用泻药等药物，以免掩盖病情。保持规律的生活作息和健康的饮食习惯有助于肠道健康。