月经来第一天同房可能会导致不孕不育，但是概率较小。女性月经期，子宫内膜脱落，子宫腔内产生创面，与此同时，女性免疫力下降，男性生殖器中存在细菌，经血也极易滋生细菌。月经来第一天同房可能会导致经血发生逆行，极易导致发生上行感染，患者可能发生阴道炎、盆腔炎，更甚者还可能发生子宫内膜异位症或输卵管炎症，进而导致不孕不育。
除此之外，还有一种概率较小的不孕不育可能。在月经来第一天同房，精子可能通过女性生殖道的受损黏膜进入女性体内，引起女性对精子发生一系列的免疫反应，导致女性产生抗精子抗体，包括促进生殖道巨噬细胞吞噬精子的能力，精子通过生殖道的能力受到限制，使精子损伤和精子细胞溶解等，从而导致免疫性不孕不育。